技能训练：忍者家族的小孩不论男女，都必须继承祖先的职业传统，一般从五岁开始就接受训练。训练的种类有五种，即平衡、灵敏、力量、持久及特殊技巧。平衡训练从走竹竿开始，当能够在滚圆的竹竿上行走而不滑下，就将竹竿逐渐升高，最终要升到三四十尺高，达到奔跑跳跃如履平地的境界，这样就能在树上、屋顶及墙头上下攀援，行走如飞。灵敏的训练也是如此跳过插着刀片的绳子，在布满利刃、枪尖的狭道中拐弯抹角急速穿行。持久及力量的训练最为艰苦，如双手挂在树上，支持全身，下面放满暗器，不容你松手跳下，以恐惧来激发体内的潜能作长久的支持。长跑更是忍者的基本功，要求连续跑上五十公里路而不停下来休息，日行百里是家常便饭。至于特殊技巧训练就更令人吃惊。除了上述说过的，还有徒手搏斗，投毒解毒等。化装术更是忍者的特长，他们能制造人皮假脸，改换性别。让一个忍者在人群中穿行，由几个人在一旁辨认，结果各人所见都不相同，高矮胖瘦，不一而足，真可谓“千面人”。还有隐身术，其实是忍者事先挖好一个地洞，然后在逃跑时趁着尘土烟雾掩护跳入地洞，令追捕者失去目标，以为真有“隐身术”。不过一般这样的洞都是挖在树林等便于遮掩躲藏的地方，像电影里那样在水泥地上消失也太夸张了。
体能训练：忍术对于身体训练的强度也是非常残忍的。忍术所包括的内容，每一项忍者都必须精通。并且每项训练，都全是死亡淘汰赛，无法承受的人是不允许生存的。除了常规训练外，忍术还包括多种“怪力训练”，忍者通过它进一步磨练意志，忍耐力，生存能力等等。这种怪力训练诸如连续数天不食不动，杀死自己的同伴，以及与猛兽搏斗等，是令人难以想象的。
通过这些死亡率极高毫无人性的修行，忍者从精神到肉体都实现了超人的飞越。获得了超越常人的毅力、耐力、战斗力。通过忍术的训练而幸存的忍者，个个都是一部绝对可靠的全功率战斗机器。
战国时代中，虽然同为大名服务，不过忍者和武士的身份分别可谓天上地下，形象一点说就是忍者是家奴，武士是家臣。由于忍者们干的大都是涉及到上层权力争斗的秘密事件，而且危险性相当大，因此他们的结局往往十分可悲。危险首先来自雇主。这些阴险毒辣的社会头面人物在不择手段达到自己的目的后，怕事情内幕泄露，往往将执行任务的忍者杀死灭口。
忍者最可怕的敌人是武士。武士在明处，忍者在暗处，防不胜防，故武士最憎恨忍者，忍者一旦被武士捕获，必然受到最残酷的刑罚处死。活剥皮就是酷刑的一种，皮肤被一片片剥下来，极其痛苦，而又不能立即死掉。所以忍者是绝对不肯让武士活捉的。例如传奇般的忍者猿飞，他叫这个名字是因为他有像猿猴一样在树上攀援飞跃的本领，来去无踪;同时他徒手格斗的武功也很好，人们根本无法捕捉他。有一次他被派去侦察住在某城堡中的一个大名，偷听到大名和一位大臣的密谈。可当他离开城堡时被守卫发现，他立即跃上城墙，巧妙地避开了追赶的人，但当他跳落花园时，踩上了一只暗设的捕熊钢夹，将他的腿紧紧夹住。这时将军手下的卫士围了上来，猿飞见状，一刀将夹住的腿砍断，单脚逃了很长一段距离。可终因失血过多，难以支持。猿飞见卫士越来越近，知道自己没有希望逃脱，便索性站定、大声辱骂了追赶他的卫士，用剑毁掉自己的面容，使人无法辨认，然后挥剑砍断自己的脖子。一个闻名遐迩的忍者就这样可悲地结束了自己的一生。
3.忍者的修罗场
1562年，80名忍者进攻一个叫做神代的城堡。他们的任务是在城外200名士兵的协助下纵火，这是忍者在袭击敌人城市时最常用的手法。因为多地震台风，日本房屋大多由薄木板制成墙壁，屋顶铺着稻草，所以一点火星就足以酿成大祸。忍者在攻城时寂静无声，他们从城外隐蔽的地方冲进城里，用各种方法偷袭哨兵，在无声中渗透进去。这些忍者换上被杀死敌人的军服，在城内各处放火。城内一片大乱，200余人被烧死，城外的士兵们轻而易举地占领了城堡。
在1638年的岛原之乱最后阶段，幕府雇佣来的忍者们表现出极高的间谍素质。这些忍者们对原城堡进行了详尽的侦查，包括护城河、周围的道路、工事和陷阱、城墙的厚度与高度、坍塌部位和薄弱点、�望哨位和射击口位置等等都被详尽记录。此外，忍者们还换上起义军的服装混入城内，他们窃取了口令摸到粮库旁边，确认了城中已经没有粮食，这份情报直接宣判了起义者的死刑。