日本德川时代初期的岛原大名松仓胜家是个虐待狂，他喜欢强迫交不起租子的农民穿上沾满油的蓑衣，然后一把火烧死，还把这种酷刑命名为“蓑衣舞”。这种行为无论放在哪里都是令人无法忍受的，所以活不下去的农民们在1637年十月二十日发动了大起义，史称岛原之乱。当时的幕府将军德川家光大为恼火，他派遣大军镇压这帮不肯老实“跳舞”的泥腿子。由于起义军中有很多参加过战国混战的浪人，所以幕府军队始终无法攻克起义军的大本营原城。1638年元旦，平叛总指挥板仓重昌都被流弹击中身亡。将军家光赶紧派诡计多端的松平信纲赶赴前线指挥，松平不愧是日本了不起的智谋之士，他盘算半天之后拿出了万全之策：大伙就在城下守着，先派人进去看看城里粮草多不多。派谁去呢，那就是刚从古贺雇佣来的职业间谍――忍者。
1.《孙子兵法》的倭岛传人
忍者是个很玄妙的话题，似乎人人都大概知道他们，却又说不清他们的过去和现在。只是在影视作品中看到忍者们飞檐走壁，神气十足的模样。在日本的历史上使用忍者做间谍是有着悠久传统的，忍术是由忍者的家族世代相传的。在各流派中，也有类似中国青、洪帮内那种森严的等级。忍者分为上忍、中忍、下忍。上忍：又称“智囊忍”，专门策略作战整体计划。中忍：实际作战时的指挥头子，当然忍术也得超群出众才行。下忍：又称“体忍”，相当于现代的特种部队，在最前线冲锋陷阵的炮灰忍者。
忍者这个称谓是在日本江户时代开始有的，不过忍者的历史从更为久远的时候便开始了。据说在日本首次派谴“忍者”完成任务的，是圣德太子。在当时，忍者被人们称为“志能便”。根据时代和地点的不同，有各种各样的称谓以下是各个时期忍者的当时的称谓：飞鸟�代：“志能便”;奈良�代：“斥候”;战国�代：叫法甚多，流传最广的叫法是“乱波”，这是武田信玄给起的名字。江户时代：“忍者”。
忍术，又名隐术。关于忍术和忍者的起源说法不一，中国有学者认为，忍术起源于中国汉代的五行术，后来传到了日本。同空手道、柔道、少林寺拳法等日本武技一样，忍术是由中国古武术传到日本后逐步发展起来的日本特色武术。日本的古典忍术权威著作《万川集海》中指出：忍术思想的根源来自中国周朝的姜子牙姜老特务。是他首先提出了忍术概念，并写在了传世名著《六韬》之中。后来，孙武、张良、韩信等相继对忍术理论进行了完善。特别是孙武的《孙子兵法》倍受忍者阶级推崇。此时忍术也基本形成了由权谋、形成、阴阳、技巧等几部分构成的雏形。随着忍术传到日本，忍者也就在日本出现并发展起来。
至于忍术的理论基础是由中国传来日本的《孙子兵法》演化而来的，之后再加上修练道和山中伏击战技巧综合而成。735年返回日本的遣唐留学生吉备真备带回了《唐礼》13卷和历书、兵书、音乐书、武器、乐器、测量器具等，他是将中国《孙子兵法》引入日本的第一人，也是忍者思想的引路人之一。关于神秘的山中伏击战，其实它的起源是贫瘠地区的日本农民在山谷中埋伏抢夺旅客财物的强盗袭击，后来发展为所谓的“风、林、火、山”四字真言。在平安时代时武士阶级兴起之后大力吸取了山伏击战的兵法加以发展。到了源平时代，源义经成功的使用了山中伏击的技巧，完成了攻击面战法的理论。在南北朝时代,楠木正成发展出防御面的兵法，到此为止，忍术跟武术才分开成不同的系统正式独立出来。在日本的早期官方史书《续日本纪》中详尽记载了《孙子兵法》的内容，并对其中的间谍内容赞叹不已。在早期的武士战争故事中，就有过使用忍者间谍的记载，在编撰于940年的《绳文记》一书中就记载了一个被雇佣的忍者执行刺杀任务的故事。
来自中国和朝鲜的移民与日本忍者的发展也有极大的渊源。因为古代日本很落后，所以日本政府非常欢迎来自科技文化高度发达的中国移民到日本定居，因而受到中华文明熏陶的朝鲜人也受到欢迎，日本人把这些移民叫做“归化人”。虽然欢迎，但还是歧视他们，移民很难进入上流社会，而且不能沿用原居住地的语言和文化，必须改成日本姓名使用日语。这些古代的技术移民将大量的先进科学技术和文化知识带到了日本，例如制造陶器、盔甲、服装技术，以及决定性的促进了日本忍术发展的中国武术。因为忍者的出身多半来自社会最底层的农民，而不是出身高贵的武士。所以作为很难被上流社会接纳的移民，“归化人”们也大量的进入了忍者这一行业。“归化人”通常都定居京都，随后有大量的人迁移到到附近的伊贺或甲贺去居住，这也是和两个地方忍术异常发达的主因。例如大名鼎鼎的服部半藏正成就是中国人，他姓秦，秦氏家族是公元三世纪末四世纪初时从中国吴国(日本和服的传统称呼是“吴服”，正是取自秦氏家族出身的吴国)渡海定居日本的，之后就改了个日本姓服部。服部半藏投效德川家康，后来移居江户。传说中这位忍者最终悟出了忍的真谛，这是多少代忍者所不曾有过的，至今日本人提起他来还是交口称赞“鬼半藏”的传奇――那是大大的“吆西”!。